A serra da Estrela, alberga o mais importante conjunto de lagoas naturais existente em Portugal. Localizadas na sua maioria acima dos 1500m de altitude, estas lagoas, são o resultado da acção dos gelos do ultimo período glaciário.
A acção erosiva e acumulação de sedimentos glaciários resultantes do movimento do gelo, permitiu o aparecimento de bacias, na grande maioria pouco profundas, posteriormente preenchidas pela água do degelo.
A estas, juntam-se ainda as barragens e albufeiras do aproveitamento hidroeléctrico da Serra da Estrela, que constituem as maiores massas de água existentes na região.
Todo este conjunto, pelas suas características, localização e singularidade, suportam alguns dos mais importantes ecossistemas de montanha e constituem locais únicos de ocorrência de algumas espécies de montanha em Portugal.